سیستم مدیریت امنیت زنجیره تامین ISO 28001 برای قرار دادن این خطرات در محل و مدیریت آنها به درستی طراحی شده است. شرکت ها در بخش های مختلف، بزرگ و کوچک و در زمینه های مختلف فعالیت، طبیعتا می خواهند پس از نصب این سیستم در سازمان هایشان، گواهی دریافت کنند. برای به دست آوردن گواهینامه سیستم مدیریت امنیت زنجیره تامین ISO 28001، باید به یک سازمان صدور گواهینامه درخواست دهید. تنها سند مورد نیاز در زمان درخواست، فرم درخواست است که فقط از طرف گواهینامه دریافت می شود و باید به درستی و کامل تکمیل شود. با این وجود، با این فرم، شرکت هایی که درخواست اسناد را دارند باید تمام اسنادی را که در هنگام ایجاد سیستم مدیریت ایمنی زنجیره تامین ISO 28001 تهیه کرده اند داشته باشند.
وقتی موسسات صدور گواهینامه این فرم درخواست را دریافت می کنند، آنها یک حسابرس را تعیین می کنند و ابتدا از طریق این اسناد سیستم شروع به آزمایش می کنند. این مرحله ممیزی است. اگر در طول ممیزی متوجه شده باشد که اسناد آماده شده استانداردهای سیستم مدیریت زنجیره تامین ISO 28001 را رعایت نمیکنند، این شرکت باید به صورت کتبی مطلع شود و درخواست کند که کمبودها را کامل کند. با این حال، اگر کمبود وجود نداشته باشد، سازمان صدور گواهینامه ممیزی مرحله دوم را آغاز می کند. این ممیزی در محیط کار شرکت انجام می شود و بررسی می شود که آیا فعالیت ها در چارچوب استانداردهای سیستم انجام می شود یا خیر. سرانجام یک گزارش توسط حسابرسان تهیه شده است. این سازمان گواهینامه تصمیم خود را بر اساس این گزارش می گیرد. در صورت تمایل مناسب، گواهینامه سیستم مدیریت امنیت زنجیره تامین تهیه و ارائه می شود.